Au 3^ème âge maya-quiché, le jaguar représente la déesse lune-terre. Chez les mayas les sorcières se présentent sous la forme du jaguar et sont l'expression de la lune. Sur les monuments de l'époque classique mezzo-américaine, la gueule de jaguar stylisée symbolise le ciel. Pour les mayas, le jaguar est une divinité chthonienne, expression suprême des forces internes de la terre. Il est le dieu du nombre 9, expression des pays de l'en-dessous. La terre est représentée dévorant le soleil, au crépuscule, sous la forme d'une gueule de jaguar ouverte sur l'astre. Divinité chthonienne, le jaguar est également le maître des montagnes, de l'écho, des animaux sauvages et des tambours d'appel. On l'appelle le coeur de la montagne.
Symétrique de l'aigle dans le symbolisme des forces terrestres et célestes, il donne son nom, chez les aztèques, à l'un des 2 ordres supérieurs de chevalerie, l'autre étant celui des aigles.
Pour les tupinambas, le jaguar est une divinité ouranienne céleste. Sa maison est dans le ciel. Il a 2 têtes pour dévorer le soleil et la lune. A la fin du monde, il se ruera sur les hommes pour en faire sa proie.
Dans de nombreux mythes des indiens d'Amérique du sud intervient un jaguar à 4 yeux, ce qui symbolise le don de clairvoyance des esprits nocturnes et chthoniens.
Au Brésil, le jaguar est gardien du feu, son dépositaire et premier utilisateur.